Przewlekłe stosowanie leków obniżających odporność (a takim jest azatiopryna) wiąże się z dużym ryzykiem wystąpienia powikłań pogrypowych. Dlatego osoby z osłabioną odpornością (w tym spowodowaną lekami) nie tylko mogą, ale wręcz powinny corocznie szczepić się przeciwko grypie. W Polsce dostępne są dwa typy szczepionek przeciwko grypie: szczepionki inaktywowane oraz szczepionka „żywa” donosowa. U osób z osłabioną odpornością szczepionki „żywe” są przeciwwskazane.
Coroczne szczepienie przeciwko grypie jest wskazane u pacjentów z każdym rodzajem niedoboru odporności. Inaktywowana szczepionka przeciwko grypie jest bezpieczna w tej grupie chorych. Należy jednak pamiętać o tym, że osoby leczone azatiopryną (lub innymi lekami zmniejszającymi odporność) mogą słabiej odpowiedzieć na szczepienie. Oznacza to, że skuteczność szczepionki może być mniejsza niż u osób z prawidłową odpornością.