Finansowanie bez podstawy prawnej niektórych wydatków, w tym np. podróży służbowych zagranicznych osób nie będących pracownikami Ministerstwa Zdrowia - to niektóre z nieprawidłowości stwierdzonych przez Najwyższą Izbę Kontroli w raporcie z wykonania budżetu państwa za 2010 r. Mimo to NIK pozytywnie, choć z zastrzeżeniami, oceniła wykonanie budżetu w resorcie zdrowia - ponieważ wymiar finansowy owych nieprawidłowości nie przekroczył progów przyjętych dla kontroli budżetowej (łącznie uchybienia wyniosły 67,7 mln zł, tj. 1,67% budżetu MZ).
