Znamy prorektorów Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego na kadencję 2012-2016. Prorektorem ds. nauki został dr hab. Tomasz Bączek, prof. nadzw., prorektorem ds. studenckich - dr hab. Marcin Gruchała, prof. nadzw., prorektorem ds. klinicznych - prof. dr hab. Andrzej Basiński, natomiast na prorektora ds. rozwoju i organizacji kształcenia Kolegium Elektorów wybrało prof. dr. hab. Leszka Bieniaszewskiego.