W 2012 r. oddziały wojewódzkie NFZ przeprowadziły w aptekach 1076 postępowań kontrolnych. 938 kontroli zakończyło się przekazaniem zaleceń pokontrolnych. Zakwestionowano 23 048 recept. Wartość zakwestionowanej refundacji to 1 625 883,22 zł, nałożonych kar umownych - 32 894,35 zł. Umowę z Narodowym Funduszem Zdrowia na realizację recept w 2012 roku miało 13 366 aptek oraz 1145 punktów aptecznych. Łącznie więc 14 511 podmiotów rozliczało się z Funduszem.